Bakteri memiliki ciri-ciri yang membedakannnya dengan mahluk hidup lain yaitu :
1. Organisme multiselluler
2. Prokariot (tidak memiliki membran inti sel )
3. Umumnya tidak memiliki klorofil
4. Memiliki ukuran tubuh yang bervariasi antara 0,12 s/d ratusan mikron umumnya memiliki ukuran rata-rata 1 s/d 5 mikron.Epulopiscium fishelsoni berukuran diameter 80 μm dan panjang 200-500 μm (0,2-0,5 mm) yang hidup pada ikan. Bakte ini ditemukan hidup di usus ikan sekitar Pulau Lizard, Queensland, Australia. Thiomargarita namibiensis berukuran diameter 100-750 μm (0,1-0,75 mm). Bakteri ini ditemukan di sebuah pantai di Namibia, Afrika.
5. Memiliki bentuk tubuh yang beraneka ragam
6. Hidup bebas atau parasit
7. Hidup secara sendiri-sendiri (soliter) atau berkelompok (koloni)
8. Hidup di lingkungan ekstrim seperti pada mata air panas,kawah atau gambut dan hidup di sekitar kita, mulai dari daerah tropis hingga kutub, dataran rendah hingga pegunungan dan juga pada tubuh kita
dinding selnya tidak mengandung peptidoglikan
9. Termasuk jenis organisme yang jumlahnya melimpah
10. Hidupnya kosmopolit diberbagai lingkungan dinding selnya mengandung peptidoglikan
10. Hidupnya kosmopolit diberbagai lingkungan dinding selnya mengandung peptidoglikan